Этиологические факторы портального тромбоза весьма многообразны: врожденная и приобретенная гиперкоагуляция, инфекционные и воспалительные заболевания брюшной полости, новообразования, цирроз и фиброз печени, кардиоваскулярная патология, серповидноклеточная анемия, пароксизмальная ночная гемоглобинурия, травмы, введение контрастных и склерозирующих веществ, оперативные и эндоскопические вмешательства на органах брюшной полости, перитонеальный диализ, облучение, лечение цитостатиками, интоксикация мышьяком. При циррозе печени частота данного осложнения достигает 18%.
У некоторых пациентов причина тромбоза остается нераспознанной. Помимо гиперактивации процессов свертывания крови, в патогенезе играют роль замедление венозного кровотока, его турбулентный характер и поврежение эндотелия.
Тромбозом ветвей или ствола воротной вены обычно сопровождается их гнойное воспаление – пилефлебит. Последний развивается как осложнение гнойных процессов близко расположенных анатомических образований, прикрытой перфорации, иногда злокачественных процессов. Послеоперационный тромбоз воротной вены чаще всего возникает в период гиперкоагуляции (3–8-й день).