Как и для вируса гепатита C, для HGV характерно заражение парентеральным путем, то есть при попадании в кровь. Наиболее вероятно это может произойти при переливании непроверенной крови, недостаточной стерилизации медицинских инструментов или их повторном использовании, употреблении инъекционных наркотиков многоразовыми шприцами. Также известны случаи заражения пациентов перенесших трансплантацию или прошедших гемодиализ. Высока вероятность заражения половым путем. Отмечены случаи вертикальной передачи вируса от матери новорожденному. У части пациентов путь инфицирования невозможно идентифицировать.